دو سال است که پیتر نیمبل و سِر تود قلمروی هیزل‌پورت را نجات داده‌اند. از آن موقع، آن‌ها در جست‌و‌جوی ماجرا به سفرهای دور و درازی رفته‌اند. حالا پروفسور کیک، پیتر و سِر تود را برای مأموریت تازه‌ای فراخوانده: پیداکردن دختری دوازده‌ساله به نام سوفی کوآیر.

سوفی از بیرون چهاردیواری کتابفروشی پدرش چیز زیادی نمی‌داند. او آنجا کتاب‌های قدیمی را صحافی می‌کند و رویای گذر از مرزهای زندگی کسالت‌بارش را در سر می‌پروراند؛ اما هنگامی که پسرکی چشم‌بند به چشم همراه گربه‌اسب سخنگویش و کتابی نایاب و مرموز از راه می‌رسد، سوفی می‌فهمد پایش به ماجرایی باز شده که از هرچه تابه‌حال در کتاب‌ها خوانده فراتر است.

«سوفی کوآیر و کتاب‌های شگفت‌انگیز» در واقع جلد دوم مجموعه‌ی «پیتر نیمبل» اثر فانتزی‌نویس معروف و خالق رمان «باغبان شب»، جاناتان اکسیر است. پیتر، شخصیت شناخته‌شده‌ی کتاب «پیتر نیمبل و چشم‌های شگفت‌انگیزش»، در این جلد باید دختری به نام «سوفی کوآیر» را پیدا کند، به همین خاطر برای مخاطبانی که عاشق ماجراجویی و هیجان هستند، فوق‌العاده جذاب است. هرچند فضای این کتاب مانند جلد قبلی فانتزی، جادویی و پررمزوراز است، اما ادامه‌ی داستان قبل نیست و خواننده را با اتفاقاتی  که اصلاً انتظار ندارد، غافل‌گیر می‌کند. همچون تمام آثار اکسیر، سرعت روند داستان بالا است و خواننده از صفحه‌ی اول تا انتهای کتاب درگیر داستان و اتفاقات هیجان‌انگیز آن است. براساس قوانین بین‌المللی، حق انحصاری انتشار این کتاب به زبان فارسی در سراسر دنیا متعلق به نشر پرتقال است.